第一：功能不同
空氣凈化器主要是用來凈化室內空氣用的，包括甲醛，異味，灰塵，二手煙，細菌，霉菌，花粉等，而 除濕機 主要是用來降低或恒定室內空氣的濕度的，部分除濕機帶有加濕功能，可一定范圍內調控空氣濕度。
第二：原理不同
凈化器一般采用過濾原理，即用風機把室內污染空氣源源不斷吸進凈化機內，使之通過過濾系統即濾芯，把空氣中的細小顆粒物和異味氣體過濾吸附下來，或分解成二氧化碳和水。
除濕機也是通過風機把室內空氣源源不斷吸進除濕機內，其機身里的壓縮機可以使空氣中的水分瞬間冷凝成水，流入水箱，隨著使用時間的變長，空氣中的水分越來越少，濕度自然也就降低下來了。如不理解壓縮機除濕原理的話可以去看一下家里的空調，空調一開，沒多長時間水管就有水出來，那水原本就是室內空氣中水分，空調也有除濕功能，不過沒除濕機專業高效罷了。
部分除濕機品牌沒有采用壓縮機而是采用轉輪技術，它是把室內濕空氣吸進機內，然后瞬間被加熱再被冷凝成水，然后流入水箱。采用轉輪技術的除濕機相對與采用壓縮機技術的除濕機價格稍高，體積重量相對較小，除濕速度快，冬季等低溫環境下使用除濕速度基本不受影響。
除濕機在進風口處大多都有一個銀離子過濾網，主要進行一些簡單的過濾毛發纖維灰塵或有點殺菌的作用，但跟凈化機的凈化效果完全不能比。